遗传病全外显子测序简介

●检测临床意义:

基因检测是各类遗传病精确诊断、指导治疗、评估预后及疾病预防与控制的关键。全外显子测序(Whole-exome sequencing,WES)是目前临床应用频率最高的基因组测序方法之一。外显子是人类基因组的蛋白编码区域,利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。虽然外显子区域仅占全基因组1%左右,却包含了85%的致病变异。相比全基因组测序,全外显子测序更加经济、高效。

本项目采用的WES检测探针具有目标区域覆盖度高、测序质量好、可检测深度内含子区域已知致病变异、可整合线粒体基因组检测等优点。本科室深耕遗传病检测多年,具有丰富的临床经验,可针对OMIM数据库中几乎所有明确致病的4,000多个基因和6,000多种遗传病进行解读,此外还可以额外检测线粒体基因上的致病位点以及HGMD/ClinVar数据库中记录致病的深度内含子位点,全方位辅助临床寻找基因层面的致病原因。


●检测适应症和禁忌症:

适应症:

1. 优先推荐送检WES的适应症包括:儿童智力障碍、发育迟缓和/或孤独症谱系障碍、癫痫、新生儿多系统畸形/代谢异常/惊厥等NICU常见病种、神经系统遗传病);

2. 有单基因遗传病家族史的人群;

3. 经过相应疾病panel检测结果为阴性、需要更大范围寻找可能遗传病因的患者;

4. 临床高度怀疑是基因突变导致的疾病(包括但不局限于神经系统、内分泌代谢系统、血液系统、免疫系统、消化系统、心血管系统、泌尿系统、骨骼系统、呼吸系统等各系统疾病,及耳聋、眼病、皮肤病等);

5. 产前超声检查或核磁共振影像学发现胎儿存在结构畸形的情况进行相关遗传病因学筛查。

禁忌症:

1. 输血后三个月内的患者;

2. 有造血干细胞移植史的患者;

3. 不适宜用WES检测的遗传病种,包括:存在基因组假基因干扰的疾病,例如先天性肾上腺皮质增生(CYP21A2基因相关)、色素失禁症(IKBKG基因)等;脆性X综合征、脊髓小脑共济失调、亨廷顿舞蹈症、肯尼迪病、强直性肌营养不良等多以动态突变为主的疾病;Prader-Willi综合征(小胖威利)、Angelman综合征等基因组印迹疾病;甲型血友病(以F8基因倒位变异为主)、α-地中海贫血(以大片段缺失为主)等。

●标本采集注意事项

1. 标本类型:EDTA-K2抗凝的外周静脉血2管,每管2-3ml。

2. 送检时间:

1)住院病人样本:周一至周五上午8:00-12:00,下午14:00-17:30,采样后由家属携带病历一并送至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口,并签署检测知情同意书;

2)普通门诊患者:周一至周五上午8:00-12:00,下午14:00-17:30,挂相应专科医生号(至本科室就诊可挂妇产科下“遗传咨询及产前诊断”医生号),开单缴费后,至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口,签署检测知情同意书并采血。

3)产前诊断患者:周一至周五上午8:00-12:00,下午14:00-17:30,挂妇产科下“遗传咨询及产前诊断”医生号,开单缴费后,至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口预约羊水穿刺时间,羊水穿刺当天签署检测知情同意书并采样。

4)周六、周日送检样本需周五17:30前预约,预约电话(028)-87393280。

3. 报告时间:

1)产后血液样本:30-60个自然日,阳性结果需经额外实验验证,可能花费较久时间。

2)产前羊水样本:30个自然日内。