疑难遗传病全基因组测序简介

●检测临床意义：

近年来靶向测序和全外显子组测序（whole exome sequencing，WES）得到广泛认可，逐渐成为辅助医生进行遗传病诊断的重要工具。这些检测手段尽管有效，仍然存在一些技术限制，特别是在检测结构变异等方面，导致目前仍有大量遗传病患者未获遗传学病因诊断。

本项目采用的全基因组测序（whole genome sequencing，WGS），对受检者基因组中的全部DNA序列进行检测，较WES所覆盖的区域更广，不仅覆盖了几乎全部基因的外显子序列，也覆盖了内含子序列和基因间序列。可有效避免在对相关基因组区域进行靶向富集时产生的技术偏差，不仅可以检出单核苷酸变异，还可以对结构变异进行分析，并常规性地对线粒体基因组变异进行分析。因此，WGS应用于临床遗传诊断有望提高疑难病例的诊断率，缩短诊断流程，节省时间及降低反复诊疗产生的费用。

●检测适应症和禁忌症：

适应症：

1. 优先推荐送检WGS的适应症包括：高度怀疑患者有遗传病的可能（如临床症状、体征和其他检测结果提示，家族史阳性或近亲结婚家系），但先前经过如染色体核型、低深度全基因组测序/微阵列芯片或WES等一种或多种遗传学检测未获得明确的分子诊断；患者表型为非特异性（不明原因的智力落后和(或)发育迟缓、非已知综合征的多发畸形等）或临床诊断明确但目标疾病遗传异质性高（如先天性白内障、腓骨肌萎缩症、脑白质病等），为获得时间或经济效益而寻求一次性、全面性的遗传学检测（新生儿重症患儿等）。

2. 可使用WGS，但应结合具体情况选择优先的检测方法：目标疾病遗传异质性低，虽已有公认的靶向检测方法，但有可能部分致病变异（非编码区变异等）不在靶向检测的范围内。

禁忌症：

1. 输血后三个月内的患者；

2. 有造血干细胞移植史的患者；

3. 不适宜用WGS检测的遗传病种，包括：目标疾病致病基因的相当一部分变异类型不在WGS检测范围内，例如Beckwith-Wiedemann综合征等基因印迹疾病；目标疾病致病基因存在同源区域等情况，如先天性肾上腺皮质增生（CYP21A2基因相关）等。

●标本采集注意事项

1. 标本类型：EDTA-K2抗凝的外周静脉血2管，每管2-3ml。

2. 送检时间：

1）住院病人样本：周一至周五上午8:00-12:00，下午14:00-17:30，采样后由家属携带病历一并送至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口，并签署检测知情同意书；

2）普通门诊患者：周一至周五上午8:00-12:00，下午14:00-17:30，挂相应专科医生号（至本科室就诊可挂妇产科下“遗传咨询及产前诊断”医生号），开单缴费后，至三住一楼“产前诊断中心”采血窗口，签署检测知情同意书并采血。

3）周六、周日送检样本需周五17:30前预约，预约电话(028)-87393280。

3. 报告时间：

60个自然日内。